ولدت ميشيل فايفر في سانتا آنا ، كاليفورنيا ، لدونا جان (تافيرنا) وريتشارد فايفر ، مقاول تدفئة وتكييف. لديها شقيق أكبر سنا وشقيقتان أصغر سنا - ديدي فايفر ولوري فايفر ، اللذان شاركا في التمثيل والنمذجة ، لكنهما قررا عدم القيام بعملهما في حياتهما. كان والداها في الأصل من ولاية داكوتا الشمالية. كان لوالدها أصول من الجزر الألمانية والبريطانية ، وكانت والدتها من أصل سويسري ألماني ونصف سويدي.