ولدت إيما طومسون في 15 أبريل 1959 في بادينغتون ، لندن ، لعائلة من الممثلين - الأب إريك طومسون والأم فيليدا لو ، التي شاركت ببطولة تومسون في العديد من الأفلام. شقيقتها ، صوفي طومسون ، هي أيضا ممثلة. كان والدها مولودًا باللغة الإنجليزية وأمها مولودة في اسكتلندا. تمت زراعة الطرافة في ثومبسون من خلال جو عائلي مبهج وذكي ومبتكر ، وكانت طالبة ناجحة وناجحة. التحقت بجامعة كامبريدج ، حيث كانت تدرس الأدب الإنجليزي ، وكانت جزءًا من مجموعة Footlights التابعة للجامعة ، المجموعة الشهيرة ، حيث سبق أن التقى العديد من أعضاء مونتي بيثون.